Сейсенбіде ол жүрек талмасымен Барселона ауруханасына жеткізіліп, тәулік бойы оңалту бөлімінде болды. Соңғы кездері Самаранч жүрек ауруымен бірнеше қайтара дәрігерлерге қаралған еді.
Хуан Антонио Самаранч ХОК-ты 1980 жылдан 2001 жылға дейін басқарды.
2001 жылы Мәскеудегі Халықаралық Олимпиада комитетінің президенті лауазымына Жак Рогге тайындалған - МОК сессиясынан қайтып оралғаннан кейін ол 11 күнін швейцариялық клиникада өткізген болатын.
Самаранчты жаңа дәуірдегі спорт тарихындағы аса беделді тұлғалардың бірі деп атайды.